Computational Toxicology: Risk Assessment for Pharmaceutical and Environmental Chemicals
暫譯: 計算毒理學：藥品與環境化學品的風險評估

Sean Ekins

Computational Toxicology: Risk Assessment for Pharmaceutical and Environmental Chemicals
  • 出版商: Wiley
  • 出版日期: 2007-07-01
  • 售價: $6,920
  • 貴賓價: 9.5 折 $6,574
  • 語言: 英文
  • 頁數: 814
  • 裝訂: Hardcover
  • ISBN: 0470049626
  • ISBN-13: 9780470049624

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商品描述

Description

A comprehensive analysis of state-of-the-art molecular modeling approaches and strategies applied to risk assessment for pharmaceutical and environmental chemicals

This unique volume describes how the interaction of molecules with toxicologically relevant targets can be predicted using computer-based tools utilizing X-ray crystal structures or homology, receptor, pharmacophore, and quantitative structure activity relationship (QSAR) models of human proteins. It covers the in vitro models used, newer technologies, and regulatory aspects. The book offers a complete systems perspective to risk assessment prediction, discussing experimental and computational approaches in detail, with:

  • An introduction to toxicology methods and an explanation of computational methods

  • In-depth reviews of QSAR methods applied to enzymes, transporters, nuclear receptors, and ion channels

  • Sections on applying computers to toxicology assessment in the pharmaceutical industry and in the environmental arena

  • Chapters written by leading international experts

  • Figures that illustrate computational models and references for further information

This is a key resource for toxicologists and scientists in the pharmaceutical industry and environmental sciences as well as researchers involved in ADMET, drug discovery, and technology and software development. 

 

Table of Contents

Series Introduction.

Preface.

Acknowledgments.

Contributors.

PART I: INTRODUCTION TO TOXICOLOGY METHODS.

1. An Introduction to Toxicology and Its Methodologies (Alan B. Combs and Daniel Acosta Jr.).

2. In Vitro Toxicology: Bringing The In Silico and In Vivo World Closer (Jinghai J. Xu).

3. Physiologically-Based Pharmacokinetic/Pharmacodynamic Modeling (Brad Reisfeld, Arthur N. Mayeno, Michael A. Lyons and Raymond S. H. Yang).

4. Cross-Species Differences In Receptor-Mediated Gene Regulation (Edward L. LeCluyse and J. Craig Rowlands).

5. Toxicogenomics and Systems Toxicology (Michael D. Waters, Jennifer M. Fostel, Barbara A. Wetmore and B. Alex Merrick).

PART II: COMPUTATIONAL METHODS.

6. Toxicoinformatics: An Introduction (William J. Welsh, Weida Tong and Panos G. Georgopoulos).

7. Computational Approaches for Assessment of Toxicity - A Historical Perspective and Current Status (Vijay K Gombar, Brian E Mattioni, Craig Zwickl and Thom Deahl).

8. Current QSAR Techniques for Toxicology (Yu Zong Chen, Chun Wei Yap and Hu Li).

PART III. APPLYING COMPUTERS TO TOXICOLOGY ASSESSMENT: PHARMACEUTICAL.

9. The Prediction of Physicochemical Properties (Igor V Tetko).

10. Applications of QSAR to Enzymes Involved In Toxicology (Sean Ekins).

11. QSAR-Studies on Drug Transporters Involved In Toxicology (Gerhard F. Ecker and Peter Chiba).

12. Applications Of QSAR To Receptors Involved In Toxicology (Angelo Vedani and Markus Lill).

13. Applications Of QSAR Methods To Ion Channels (Alex M. Aronov, Konstantin V. Balakin, Alex Kiselyov, Shikha Varma-O’Brien and Sean Ekins).

14. Predictive Mutagenicity Computer Models (Laura L. Custer, Constantine Kreatsoulas and Stephen K. Durham).

15. Novel Applications of Kernel-Partial Least Squares to Modeling A Comprehensive Array Of Properties For Drug Discovery (Sean Ekins, Mark J. Embrechts, Curt M. Breneman, Kam Jim and Jean-Pierre Wery).

16. Homology Models Applied To Toxicology (Stewart B. Kirton, Phillip J. Stansfeld, John S. Mitcheson and Michael J. Sutcliffe).

17. Crystal Structures Of Toxicology Targets (Frank E. Blaney and Ben G. Tehan).

18. Expert Systems (Philip Judson).

19. Strategies for Using Computational Toxicology Methods in Pharmaceutical R&D (Lutz Müller, Alexander Breidenbach, Christoph Funk, Wolfgang Muster and Axel Pähler).

20. Application of Interpretable Models to ADME/TOX Problems (Tomoko Niwa and Katsumi Yoshida).

PART IV APPLYING COMPUTERS TO TOXICOLOGY ASSESSMENT: ENVIRONMENTAL.

21. The Toxicity and Risk of Chemical Mixtures (John C. Lipscomb, Jason C. Lambert and Moiz Mumtaz).

22. Environmental and Ecological Toxicology - Computational Risk Assessment (Emilio Benfenati, Giovanna Azimonti, Domenica Auteri and Marco Lodi).

23. Application of QSARs In Aquatic Toxicology (James Devillers).

24. Dermatotoxicology:Computational Risk Assessment (Jim E. Riviere).

PART V. NEW TECHNOLOGIES FOR TOXICOLOGY, FUTURE AND REGULATORY PERSPECTIVES .

25. Novel Cell Culture Systems - Micro And Nanotechnology For Toxicology (Mike Shuler and Hui Xu).

26. Future of Computational Toxicology: Broad Application into Human Disease and Therapeutics (Dale E. Johnson, Amie D. Rodgers and Sucha Sudarsanam).

27. Computational Tools for Regulatory Needs (Arianna Bassan and Andrew P. Wo).

商品描述(中文翻譯)

**描述**

本書全面分析了最先進的分子建模方法及其在藥物和環境化學品風險評估中的應用策略。這本獨特的著作描述了如何利用基於計算的工具，通過 X 射線晶體結構或同源性、受體、藥效團及人類蛋白質的定量結構-活性關係（QSAR）模型來預測分子與毒理學相關目標的相互作用。內容涵蓋了所使用的體外模型、新技術及監管方面。本書提供了風險評估預測的完整系統觀點，詳細討論了實驗和計算方法，包括：

- 毒理學方法的介紹及計算方法的解釋
- 應用於酶、運輸蛋白、核受體和離子通道的 QSAR 方法的深入評估
- 在藥物行業和環境領域中應用計算機進行毒理學評估的部分
- 由國際領先專家撰寫的章節
- 說明計算模型的圖示及進一步資訊的參考文獻

這是毒理學家、藥物行業和環境科學的科學家，以及參與 ADMET、藥物發現和技術及軟體開發的研究人員的重要資源。

**目錄**

系列介紹。
前言。
致謝。
貢獻者。

**第一部分：毒理學方法介紹。**
1. 毒理學及其方法論介紹（Alan B. Combs 和 Daniel Acosta Jr.）。
2. 體外毒理學：將計算機模擬與體內世界更緊密地結合（Jinghai J. Xu）。
3. 生理基礎藥物動力學/藥效學建模（Brad Reisfeld、Arthur N. Mayeno、Michael A. Lyons 和 Raymond S. H. Yang）。
4. 受體介導的基因調控中的跨物種差異（Edward L. LeCluyse 和 J. Craig Rowlands）。
5. 毒理基因組學和系統毒理學（Michael D. Waters、Jennifer M. Fostel、Barbara A. Wetmore 和 B. Alex Merrick）。

**第二部分：計算方法。**
6. 毒理信息學：介紹（William J. Welsh、Weida Tong 和 Panos G. Georgopoulos）。
7. 毒性評估的計算方法 - 歷史視角和當前狀況（Vijay K Gombar、Brian E Mattioni、Craig Zwickl 和 Thom Deahl）。
8. 當前的 QSAR 技術在毒理學中的應用（Yu Zong Chen、Chun Wei Yap 和 Hu Li）。

**第三部分：將計算機應用於毒理學評估：藥物。**
9. 物理化學性質的預測（Igor V Tetko）。
10. QSAR 在毒理學中涉及的酶的應用（Sean Ekins）。
11. QSAR 研究在毒理學中涉及的藥物運輸蛋白（Gerhard F. Ecker 和 Peter Chiba）。
12. QSAR 方法在毒理學中涉及的受體的應用（Angelo Vedani 和 Markus Lill）。
13. QSAR 方法在離子通道中的應用（Alex M. Aronov、Konstantin V. Balakin、Alex Kiselyov、Shikha Varma-O’Brien 和 Sean Ekins）。
14. 預測性突變性計算機模型（Laura L. Custer、Constantine Kreatsoulas 和 Stephen K. Durham）。
15. 核心-偏最小二乘法在藥物發現中建模綜合性質的創新應用（Sean Ekins、Mark J. Embrechts、Curt M. Breneman、Kam Jim 和 Jean-Pierre Wery）。
16. 應用於毒理學的同源模型（Stewart B. Kirton、Phillip J. Stansfeld、John S. Mitcheson 和 Michael J. Sutcliffe）。
17. 毒理學目標的晶體結構（Frank E. Blaney 和 Ben G. Tehan）。
18. 專家系統（Philip Judson）。
19. 在藥物研發中使用計算毒理學方法的策略（Lutz Müller、Alexander Breidenbach、Christoph Funk、Wolfgang Muster 和 Axel Pähler）。
20. 將可解釋模型應用於 ADME/TOX 問題（Tomoko Niwa 和 Katsumi Yoshida）。

**第四部分：將計算機應用於毒理學評估：環境。**
21. 化學混合物的毒性和風險（John C. Lipscomb、Jason C. Lambert 和 Moiz Mumtaz）。
22. 環境和生態毒理學 - 計算風險評估（Emilio Benfenati、Giovanna Azimonti、Domenica Auteri 和 Marco Lodi）。
23. QSAR 在水生毒理學中的應用（James Devillers）。
24. 皮膚毒理學：計算風險評估（Jim E. Riviere）。

**第五部分：毒理學的新技術、未來和監管前景。**
25. 新型細胞培養系統 - 用於毒理學的微型和納米技術（Mike Shuler 和 Hui Xu）。
26. 計算毒理學的未來：廣泛應用於人類疾病和治療（Dale E. Johnson、Amie D. Rodgers 和 Sucha Sudarsanam）。
27. 監管需求的計算工具（Arianna Bassan 和 Andrew P. Wo）。

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